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Aislamiento de exosomas: cómo comparar métodos y cuándo usar TFF

Comparación de los métodos para aislar exosomas y vesículas extracelulares, con las ventajas de la filtración de flujo tangencial (TFF) frente a la ultrafiltración convencional y ejemplos de métodos combinados.

Esta guía le ayuda a elegir un método para aislar y concentrar exosomas y otras vesículas extracelulares (EV). Compara los métodos habituales, explica qué diferencia a la filtración de flujo tangencial (TFF) de la ultrafiltración convencional y resume combinaciones de métodos publicadas.

Qué son las vesículas extracelulares

Los exosomas son vesículas diminutas liberadas por las células. Contienen biomoléculas, como proteínas y secuencias, que pueden modificar el funcionamiento de las células cercanas. Por eso se estudian para entender la comunicación entre células y el desarrollo de enfermedades.

La fuente distingue tres tipos de vesículas extracelulares:

Tipo Tamaño Origen
Exosomas 40~120 nm Cuerpos multivesiculares (MVB), vía endolisosomal
Microvesículas 100~1000 nm Membrana plasmática, gemación hacia el exterior
Cuerpos apoptóticos 1000~5000 nm Membrana plasmática, durante la apoptosis

Origen de las vesículas extracelulares (exosomas), ilustración de Rocker.

Como el origen biológico de cada vesícula es difícil de demostrar, la Sociedad Internacional de Vesículas Extracelulares (ISEV) recomendó en su guía MISEV2018 nombrarlas por:

  • Características físicas: por ejemplo, tamaño pequeño, mediano o grande (sEV, mEV, lEV) o densidad.
  • Marcadores de superficie o composición bioquímica: por ejemplo, EV CD81+ o EV teñidas con anexina A5.
  • Condiciones o célula de origen: por ejemplo, EV de podocitos, EV hipóxicas, oncosomas grandes o cuerpos apoptóticos.

Frente a portadores sintéticos como los liposomas y las nanopartículas, los exosomas son endógenos y heterogéneos. Pueden transportar sustancias bioactivas a células diana y participar en procesos como la reparación de tejidos, la regulación inmunitaria, la angiogénesis, la diferenciación celular y la neoplasia. Sus limitaciones para uso clínico son la baja estabilidad, el bajo rendimiento, la baja pureza y la débil capacidad de dirigirse a un blanco.

Por qué aislar exosomas es difícil

Aislar, purificar y concentrar (enriquecer) los exosomas es necesario para evaluar su función y usarlos en análisis posteriores. Sin embargo, las muestras biológicas contienen estructuras parecidas, como fragmentos celulares, agregados de proteínas y lipoproteínas. Además, el tamaño y la composición de los exosomas son heterogéneos.

Compare los métodos de aislamiento

Los métodos más usados son la ultracentrifugación, la cromatografía de exclusión por tamaño, la ultrafiltración, la precipitación y la inmunoafinidad.

Criterio Ultracentrifugación (UC) Cromatografía de exclusión por tamaño (SEC) Ultrafiltración (UF) Precipitación Inmunoafinidad (IA)
Principio Coeficiente de sedimentación (tamaño, densidad) Radio hidrodinámico (tamaño, peso molecular) Tamaño de poro de la membrana (tamaño, peso molecular) Solubilidad (carga superficial) Unión específica (marcador proteico de membrana)
Rendimiento Bajo Medio Alto Alto Bajo
Pureza Media (lipoproteínas) Media a alta (lipoproteínas, albúmina) Media (proteínas) Baja (proteínas, polímeros) Alta
Funcionalidad Media Alta Media Baja Baja
Tiempo > 4 h 0,3 h (1) < 4 h ≈0,3~12 h 4~20 h
Volumen de muestra Grande Medio Grande (TFF) Grande Pequeño
Desnaturaliza o inactiva las EV Sí (alta velocidad) No Sí (esfuerzo de corte) Sí (coprecipita con proteínas o polímeros) Sí (pasos de refinamiento)
Complejidad Media Simple Simple Simple Media
Escalabilidad Media Alta Media a alta (2) Alta Baja
Otros Laboriosa y lenta Alta reproducibilidad; las EV conservan función y forma Alta reproducibilidad; uso flexible; la membrana se obstruye Polímeros difíciles de separar; kit más costoso Mejor pureza; permite estudiar subpoblaciones específicas; no separa las EV totales; anticuerpos costosos

(1) Con kits comerciales, la purificación de EV puede completarse en 20 minutos. (2) La escalabilidad alta corresponde a la filtración de flujo tangencial (TFF).

La ultracentrifugación (UC) también se denomina centrifugación diferencial (dUC).

Ultrafiltración convencional frente a TFF

La ultrafiltración separa por tamaño molecular. Puede hacerse con tubos de ultrafiltración por centrifugación, con filtros agitados a presión o con filtración de flujo tangencial (TFF).

  • Tubos de centrífuga y filtros agitados: son fáciles de operar y rápidos, pero la membrana se obstruye con facilidad. Eso reduce la eficiencia de separación y aumenta el costo.
  • TFF: reduce de forma importante el problema de obstrucción de la membrana.

Según la fuente, varios trabajos indican que, al separar EV, la TFF supera a la ultracentrifugación (UC o dUC), considerada el estándar de referencia, en rendimiento, reproducibilidad y eliminación de contaminantes. También ahorraría más de 40 % del tiempo y se adapta mejor a la producción a gran escala.

Aislamiento de exosomas mediante filtración de flujo tangencial, ilustración de Rocker.

Combine métodos para mejorar pureza y rendimiento

Ningún método cumple por sí solo con alta pureza y alto rendimiento. Por eso muchos equipos combinan técnicas; la fuente señala que la combinación aumenta el rendimiento y la pureza más que un método único. Algunos ejemplos:

  • UC y UF para una extracción inicial, seguidas de IA para purificar los exosomas objetivo.
  • UC y SEC para procesar volúmenes grandes y reducir la interferencia de contaminantes.

Al combinar métodos, revise si alguno puede desnaturalizar o inactivar los exosomas.

La fuente recopila ocho estudios (2018 a 2023) que usan TFF junto con otras técnicas:

N.° Objetivo Combinación Función de la TFF Poro o corte de la membrana Muestra
1 Exosomas TFF → SEC Purificación y concentración 5 nm Medio de cultivo celular (DP-MSC)
2 EV TFF → SEC Purificación y concentración 50 ± 10 nm Sobrenadante de HPL
3 Exosomas UC → TFF Concentración 5 nm Medio de cultivo celular (células NK-92)
4 EV vegetales dUC → TFF Concentración 5 nm Medio de cultivo celular (tabaco)
5 Exosomas (TFF) → kit exoEasy Maxi (Qiagen) / SEC Concentración (10~20X) 5 nm Medio de cultivo celular (células cancerosas)
6 Exosomas Centrifugación a baja velocidad (300g) → TFF Purificación y concentración 100 kDa Medio de cultivo celular (EF-MSC)
7 EV Centrifugación a baja velocidad (300g) → TFF Purificación y concentración (50X) 300 kDa Medio de cultivo celular (ASC)
8 EV TFF Purificación, concentración (4~20X) y cambio de tampón 0,65 μm, 500 kDa Medio de cultivo celular; lipoaspirado

Equipo Rocker para TFF a escala de laboratorio

Rocker recomienda para esta aplicación el sistema de filtración de flujo tangencial Tanfil 100. Según el fabricante:

  • Es un sistema todo en uno, listo para conectar y comenzar.
  • Concentra y hace diafiltración en la misma corrida.
  • Sirve para bioprocesos, incluida la concentración de ADN y ARN.
  • Facilita el escalamiento: se usan los mismos parámetros para producción en volumen.
  • Cuenta con certificaciones CE, RoHS y UKCA.

La página de Rocker también incluye entre sus productos recomendados los lavadores de microplacas BioWasher 100 y BioWasher 100-T, sin detallar su uso en este flujo. Su función se explica en la guía de ELISA.

Aplicaciones de los exosomas

  • Diagnóstico y pronóstico: biomarcadores para medicina de precisión y predicción del curso de enfermedades como Alzheimer, Parkinson, enfermedades autoinmunes y neurodegenerativas, y cáncer.
  • Tratamiento: fármacos moleculares, agentes terapéuticos y vehículos de fármacos para el tratamiento del cáncer, la medicina regenerativa y otros campos.
  • Investigación biológica: estudio de ADN, miARN y otras moléculas para entender mecanismos fisiológicos y patológicos.

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Consulte la configuración y variante en cada ficha antes de seleccionar el equipo.

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